More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1626 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  57.94 
 
 
240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  41.23 
 
 
231 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
230 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  41.26 
 
 
226 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 
224 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  39.74 
 
 
239 aa  141  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  41.36 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  39.3 
 
 
231 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  38.95 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  38.99 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  36.84 
 
 
243 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 
235 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  38.25 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
249 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.84 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
233 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  31.08 
 
 
228 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 
249 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.87 
 
 
249 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.97 
 
 
239 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 
249 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
243 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 
253 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 
253 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.53 
 
 
238 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
272 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
247 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 
264 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.05 
 
 
245 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 
239 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.61 
 
 
255 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  34.72 
 
 
250 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  32.47 
 
 
250 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.54 
 
 
240 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 
253 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  33.64 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  32.57 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  35.85 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  33.33 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 
233 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  34.26 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.33 
 
 
251 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 
250 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 
240 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.88 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  35.22 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.59 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.57 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.42 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  32.74 
 
 
257 aa  92  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.93 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  35.85 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  32.75 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.42 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.63 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.36 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.36 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 
249 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
254 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  38.79 
 
 
261 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
219 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
235 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
255 aa  89  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>