More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8203 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  70.98 
 
 
231 aa  316  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  60.81 
 
 
226 aa  271  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  62.9 
 
 
239 aa  264  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  60.45 
 
 
224 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  52.29 
 
 
230 aa  234  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  57.8 
 
 
230 aa  229  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  51.38 
 
 
230 aa  225  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  46.67 
 
 
231 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  45 
 
 
246 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  44.54 
 
 
240 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  40.62 
 
 
243 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
241 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.33 
 
 
239 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.14 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.13 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.87 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
225 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.96 
 
 
238 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  34.23 
 
 
241 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.32 
 
 
228 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
233 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 
239 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.33 
 
 
250 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
255 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.56 
 
 
228 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.65 
 
 
249 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
225 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
337 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  29.36 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  35.76 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
255 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.96 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.96 
 
 
256 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  38.36 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.96 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.78 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.7 
 
 
255 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.56 
 
 
233 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  29.6 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  29.78 
 
 
250 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  30.22 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  37.95 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  30.22 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  30.22 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  30.22 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.56 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  29.78 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.75 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  29.78 
 
 
250 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  29.78 
 
 
250 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  29.78 
 
 
250 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
251 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  31 
 
 
255 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.63 
 
 
273 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.16 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  31.25 
 
 
256 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  31.58 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.33 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  36.9 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  29.33 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  29.33 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  29.39 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  29.33 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  38.65 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  29.91 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
247 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  31.9 
 
 
247 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  27.4 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>