More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0560 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  97.73 
 
 		 225 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  79.55 
 
 		 225 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  60.73 
 
 		 225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  58.64 
 
 		 225 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  54.98 
 
 		 231 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  54.63 
 
 		 229 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  47.06 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.2 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 235 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 215 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  42.86 
 
 		 231 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  42.59 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 231 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  39.45 
 
 		 223 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.74 
 
 		 226 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 221 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 226 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  37.67 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  39.55 
 
 		 225 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  43.24 
 
 		 235 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  39.9 
 
 		 222 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  37.5 
 
 		 224 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.6 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 241 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  34.12 
 
 		 216 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  38.67 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 226 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 216 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  34.12 
 
 		 216 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 216 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  40.91 
 
 		 217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  41.81 
 
 		 229 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  39.34 
 
 		 226 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 		 235 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  40.46 
 
 		 233 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.14 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  37.62 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  40.28 
 
 		 227 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  33.17 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  30.39 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  34.27 
 
 		 231 aa  99.8  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 222 aa  99.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  36.84 
 
 		 239 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  36.71 
 
 		 226 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 233 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  36.32 
 
 		 242 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 252 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 251 aa  96.3  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.44 
 
 		 255 aa  96.3  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  38.12 
 
 		 238 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  31.88 
 
 		 222 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  35.35 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.23 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.2 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  38.28 
 
 		 234 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 235 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  37.56 
 
 		 224 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  37.98 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 230 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 253 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 253 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 223 aa  92.8  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  30.39 
 
 		 222 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.83 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 224 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.99 
 
 		 251 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  36.23 
 
 		 241 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  38.54 
 
 		 224 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  34.09 
 
 		 236 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  37.74 
 
 		 243 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.91 
 
 		 250 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 235 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 		 250 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 240 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.58 
 
 		 251 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 231 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.12 
 
 		 238 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  35.44 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  34.29 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 233 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 241 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 245 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  34.72 
 
 		 234 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 243 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>