More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0699 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  38.14 
 
 
237 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
265 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
255 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  31.72 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.5 
 
 
230 aa  95.5  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.17 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  30.91 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
337 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.13 
 
 
241 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
257 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  34.97 
 
 
225 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.3 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  34.86 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.22 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.48 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  33.66 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  33.99 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.68 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.03 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.03 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
245 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  30.28 
 
 
238 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
250 aa  89  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
258 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.41 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.41 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.73 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  30.61 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  32.21 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 
226 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  28.51 
 
 
231 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  31.25 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  29.44 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  36.6 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.94 
 
 
250 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  28.7 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
258 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  31.03 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  31.65 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.38 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  30.39 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  31.46 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  27.11 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  32.41 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.74 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.45 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.24 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.74 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.39 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  30.48 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  30.56 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  30.48 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.66 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.9 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.21 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.52 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>