More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3004 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  434  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  57.8 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  53.67 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  55.05 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  53.28 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  49.55 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  48.43 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  51.14 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  47.95 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  45.7 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  45.74 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  45.33 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  36.33 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  36.48 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.77 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  35 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  38.57 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  35.22 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  38.57 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  35.22 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  35.22 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  37.98 
 
 		 216 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  32.88 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  34.92 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.7 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  35.17 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  35.45 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  38.32 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.78 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  36.19 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.29 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  38.28 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 272 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.07 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  39.81 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  33.77 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  36.99 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  36.53 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  38.83 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.34 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  36.94 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  33.95 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  33.95 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  33.95 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  33.95 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.91 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  37.33 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.63 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.26 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  32.09 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.75 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  30.7 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  36.4 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  38.5 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 318 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  35.59 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  42.58 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  35.22 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  35.67 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  34.85 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  36.52 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  36.24 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>