More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  75.34 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  54.05 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  51.38 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  50 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  52.25 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  47.06 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  43.84 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  44.5 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  38.39 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  39.64 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.74 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  34.08 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.22 
 
 		 250 aa  104  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.6 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.67 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.87 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.58 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.96 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.44 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  35.9 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.22 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.88 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  37.01 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  32.2 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 256 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  30.22 
 
 		 244 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.73 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  29.68 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  33.69 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.47 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  28.64 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  29.68 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  36.26 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 		 253 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  34.57 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  32.06 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.74 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  30.95 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.21 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  33.94 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  33.94 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  32.06 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  32.12 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  29.05 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  38.93 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  31.84 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  35.11 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  26.85 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  27.36 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.32 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  25.76 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.02 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  32.35 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  29.7 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  32.95 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>