More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0399 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  100 
 
 
224 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  60.91 
 
 
231 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  60 
 
 
226 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  60.45 
 
 
224 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  54.09 
 
 
230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  55.3 
 
 
239 aa  227  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  52.25 
 
 
230 aa  207  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  51.14 
 
 
230 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  48.87 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  44.55 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  42.22 
 
 
240 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  35.4 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.21 
 
 
245 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  44.89 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
243 aa  128  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
241 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.79 
 
 
250 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  34.38 
 
 
240 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  38.35 
 
 
227 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.88 
 
 
241 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.15 
 
 
233 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.7 
 
 
249 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  34.08 
 
 
241 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
249 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 
233 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  44.44 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  31.94 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  37.74 
 
 
225 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  32.73 
 
 
228 aa  98.2  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  32.73 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.94 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  34.39 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.05 
 
 
264 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.8 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.16 
 
 
255 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.95 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
261 aa  95.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  35.14 
 
 
256 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
337 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.16 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  35.07 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  38.61 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  37.56 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  41.98 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  35.27 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  34.84 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  35.68 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  36 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  34 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  37.74 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  34.48 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  34.11 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  31.53 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  33.48 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
232 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
223 aa  88.6  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  34.89 
 
 
257 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
255 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 
226 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  33.02 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.58 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 
249 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  35.61 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  32.2 
 
 
235 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1150  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
257 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  38.81 
 
 
224 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 
235 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>