More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1631 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.04 
 
 		 233 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.07 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  27.83 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  32.54 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.63 
 
 		 241 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.02 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.2 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.31 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  36.1 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.33 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  31.22 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.57 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.92 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  25.23 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.06 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.48 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.53 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.97 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.59 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.88 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 230 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  32.41 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.3 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  35.87 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  30.39 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  30.6 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  31.8 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  31.2 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  33.48 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  35.53 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  32.86 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  33.83 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  32.21 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.58 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  31.38 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.6 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  27.71 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.48 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.4 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  33.47 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  27.34 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>