More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1141 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  79.74 
 
 		 235 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  46.98 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  50.85 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  47.64 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  44.87 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  41.99 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  39.01 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  37.66 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  37.66 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  40.17 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  39.65 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  36.17 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.19 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  35.29 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  37.22 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.19 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  35.29 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  34.35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  36.44 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.9 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  35.9 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  37.89 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  34.4 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  36.09 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.5 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.14 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  34.76 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 270 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.7 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.04 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  33.95 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.17 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  37.02 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  33.05 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  35.47 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  35.47 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  36.32 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  32.72 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  33.48 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 288 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.9 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  31 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 268 aa  99  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>