More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3756 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  59.91 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  54.31 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  52.27 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  49.77 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  50.46 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4243  GntR domain-containing protein  47.65 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.45 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  39.17 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  35.71 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  35.51 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  38.78 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  36.11 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.6 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  34.09 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  37.44 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.64 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  33.62 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  33.65 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.77 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  35.1 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.71 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 337 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  33.33 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.46 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.46 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  32 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  31.46 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  35.35 
 
 		 273 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.14 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.89 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.84 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  34.08 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.22 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.51 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.73 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  32.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  32.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  32.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  33.18 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.48 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.69 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  32.17 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.89 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  30.94 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.45 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  33.13 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  32 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  33.99 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.05 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.86 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  33.94 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>