More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1410 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  100 
 
 
237 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  43.66 
 
 
285 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  35.96 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.18 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  32.46 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.73 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.25 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.66 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  30.26 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  30.26 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.26 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.26 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  37.91 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  30.26 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.26 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.26 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.69 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  31.12 
 
 
235 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  33.2 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  33.2 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  33.2 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  34.89 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  31.54 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  30.83 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  30.22 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.26 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  30.74 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  35.53 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.53 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 
239 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.63 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.3 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  32.53 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.82 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.3 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  31.12 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.88 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  32.96 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  29.07 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  29.07 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  30.29 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.27 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.71 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  29.2 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  29.63 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.47 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  26.78 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  31 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.58 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  29.26 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  29.26 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  23.74 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  29.86 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.16 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.17 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  30.09 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  28.9 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  26.64 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>