More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0749 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  62.04 
 
 
238 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  58.53 
 
 
258 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  45.09 
 
 
230 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  43.05 
 
 
245 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  40.19 
 
 
233 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  37.26 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
231 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
233 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  38.25 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.75 
 
 
245 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  37.39 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  36.11 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  37.61 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.28 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  31.14 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.44 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  35.81 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.57 
 
 
255 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  34.78 
 
 
239 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  36.11 
 
 
251 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  32.79 
 
 
271 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
253 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  31.6 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
252 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  31.6 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  35.87 
 
 
255 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
257 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  32.27 
 
 
247 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 
247 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  32.27 
 
 
247 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  33.64 
 
 
231 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 
253 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.53 
 
 
235 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  38.03 
 
 
249 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  38.03 
 
 
249 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  38.03 
 
 
249 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.55 
 
 
257 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.55 
 
 
257 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.55 
 
 
257 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
230 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.55 
 
 
257 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.55 
 
 
257 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
249 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  32.38 
 
 
233 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 
253 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.33 
 
 
255 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.86 
 
 
227 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 
238 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
256 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 
253 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  31.17 
 
 
244 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.91 
 
 
257 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30 
 
 
238 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  33.64 
 
 
223 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  36.62 
 
 
255 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 
226 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  33.62 
 
 
257 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  33.62 
 
 
257 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  33.62 
 
 
257 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.26 
 
 
249 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  33.03 
 
 
250 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.51 
 
 
227 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  35.92 
 
 
226 aa  99  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  35.91 
 
 
231 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.91 
 
 
252 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 
239 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  35.62 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  31.2 
 
 
268 aa  98.6  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
274 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  30.23 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.24 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.13 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 
379 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.63 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.26 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.49 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>