More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0929 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  40.62 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  39.45 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  37.56 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  38.99 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  36.89 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.4 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.74 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  34.8 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  34.93 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  34.82 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  34.56 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.09 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.26 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.35 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  34.08 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  34.08 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  32.41 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  31.02 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  32.02 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  40.22 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  35.27 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  31.02 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.75 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  34.36 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.18 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  34.36 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.43 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  32.89 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  37.99 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  31.49 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  34.23 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  33.93 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.31 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  37.99 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.94 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.94 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  35.24 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.94 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  33.94 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.04 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.04 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.04 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.04 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  33.78 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.04 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  33.04 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  33.04 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  31.65 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.04 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  34.02 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  32.59 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.92 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  39.77 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  33.61 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>