More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4648 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  96.58 
 
 
235 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  78.63 
 
 
235 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  73.57 
 
 
237 aa  339  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  49.34 
 
 
237 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  44.4 
 
 
258 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  44.69 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  35.81 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  36.75 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  36.75 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  36.75 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  36.75 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
263 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  37.44 
 
 
263 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
260 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
260 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
263 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
260 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  36.96 
 
 
260 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  37.44 
 
 
263 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
260 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 
260 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  36.75 
 
 
260 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  39.91 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  35.24 
 
 
261 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
252 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 
379 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
249 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 
226 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  32.24 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 
226 aa  99  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.3 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.82 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.88 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.22 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.24 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.46 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.52 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  27.59 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.56 
 
 
233 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  27.11 
 
 
240 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  30.08 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  26.67 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.28 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  30.6 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
248 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  26.72 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  28.04 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.11 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.88 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  27.98 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  26.47 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  32.74 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  35.39 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.45 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  28.75 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  32.2 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.15 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.51 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.89 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.67 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  28.07 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.19 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  28.97 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  31.22 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  27.06 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.71 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  31.12 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.44 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>