More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2304 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  53.48 
 
 
239 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
232 aa  244  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  49.57 
 
 
245 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  46.96 
 
 
240 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  47.39 
 
 
239 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  46.98 
 
 
241 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  44.49 
 
 
241 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  46.15 
 
 
240 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  42.49 
 
 
238 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
241 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  37.72 
 
 
243 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.21 
 
 
240 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.21 
 
 
240 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  40.1 
 
 
215 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  37.07 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.43 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  37.99 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  37.99 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.74 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.74 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.99 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.99 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.99 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  37.99 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.74 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.99 
 
 
258 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.74 
 
 
258 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 
218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.55 
 
 
258 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.6 
 
 
257 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 
218 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 
254 aa  141  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  35.35 
 
 
239 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 
218 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
218 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.43 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  38.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  38.67 
 
 
254 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
258 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
255 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  38.67 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.87 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  36.1 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  37 
 
 
235 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  37.83 
 
 
254 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  37.83 
 
 
254 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
257 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  37.93 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  36.12 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.87 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  38.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  38.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  38.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  38.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  38.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  36.64 
 
 
254 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  35.11 
 
 
270 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  36.64 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  36.21 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  34.67 
 
 
270 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
228 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  37.66 
 
 
248 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
318 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
288 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 
235 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  37.66 
 
 
238 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.6 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  35.92 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  37.5 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.04 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
251 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
257 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>