More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1023 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  90.61 
 
 		 218 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  91.04 
 
 		 218 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  91.08 
 
 		 218 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  90.61 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  90.61 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  90.61 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  90.14 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  90.61 
 
 		 218 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  90.61 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  90.61 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  61.43 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  60.95 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  40.1 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  41.9 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  43.48 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  39.13 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  41.43 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  39.42 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  36.59 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.61 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.68 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  36.41 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.47 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.54 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  35.47 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  32.86 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  34.8 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 253 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 278 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  33.66 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.01 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  35.96 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.53 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  32.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  32.51 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.58 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.08 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 262 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  104  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 		 258 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  33.65 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.65 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.28 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  35.61 
 
 		 248 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.73 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 273 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  35.61 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  29.9 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  36.23 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>