More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4274 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  87.34 
 
 		 229 aa  407  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  43.84 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  39.01 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  39.21 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  39.82 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5177  regulatory protein GntR HTH  39.38 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.835231  normal  0.258028 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  36.32 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  37.05 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  35.9 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  36.61 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4644  GntR domain-containing protein  39.91 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.028465  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  35.91 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  34.23 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.86 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.96 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.3 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.84 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.59 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  35.14 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.5 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.03 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.77 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  34.86 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.06 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  32.58 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  32.58 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  32.89 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.78 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.63 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  33.19 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  34.96 
 
 		 252 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  31.67 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.3 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.88 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 266 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.36 
 
 		 272 aa  99  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.98 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  33.04 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  34.09 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  31.96 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  30.56 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2069  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  35.11 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>