More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6442 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  97.64 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  56.1 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  56.77 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  52.8 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  52.4 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  52.4 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4644  GntR domain-containing protein  49.24 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.028465  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  37.05 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  32.44 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5177  regulatory protein GntR HTH  32.89 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.835231  normal  0.258028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  32.52 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.6 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  37.12 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.73 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.68 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  32.61 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.71 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  31.86 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.9 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  32.17 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  32.39 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  34.55 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 236 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.54 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.62 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  32.23 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.26 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.36 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  32.58 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  35.96 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  33.19 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  30.8 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  35.96 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  29.61 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  34.55 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  32.61 
 
 		 284 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  29.18 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  29.18 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.39 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2069  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  31.53 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  31.82 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>