More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0527 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  480  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  31.28 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.83 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.9 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  38.05 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.46 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  35.81 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  32.02 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  30.95 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  34.12 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  40.38 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  40.38 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.2 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  40.22 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.62 
 
 		 227 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  31.78 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.76 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.58 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  31.19 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  35.98 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  39.09 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  41.11 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  34.55 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  34.12 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  34.12 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  34.12 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.65 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  34.91 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.65 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.65 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.65 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  34.12 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  32.16 
 
 		 271 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  33.65 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  35.94 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  38.16 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.05 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  41.82 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.05 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  33.17 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  36.53 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  38.83 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  36.74 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  36.74 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  36.74 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  36.74 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  36.74 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.18 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  34.12 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  35.4 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  37.97 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  36.28 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  36.28 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  36.28 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  36.28 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  36.28 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  36.28 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.96 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>