More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1263 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  32.89 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
233 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  30.97 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.74 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  39.06 
 
 
235 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.22 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.09 
 
 
231 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
229 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
257 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 
258 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.62 
 
 
230 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  32.02 
 
 
230 aa  104  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  27.59 
 
 
233 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
221 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
252 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  27.85 
 
 
256 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  26.38 
 
 
255 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.82 
 
 
245 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  29.95 
 
 
238 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 
253 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  29.96 
 
 
223 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
255 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  29.91 
 
 
222 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
258 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  33.81 
 
 
233 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.6 
 
 
239 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  27.73 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29.82 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  26.38 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.48 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  26.38 
 
 
255 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30.88 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.54 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.22 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  29.61 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.97 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
230 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 
243 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.33 
 
 
268 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 
227 aa  98.2  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.86 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  31.25 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  31.11 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.72 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.02 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  28.11 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.97 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
337 aa  94.7  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  31.17 
 
 
247 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.9 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  30.14 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 
229 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
261 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 
215 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.96 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
225 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  32.18 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  26.54 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 
249 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 
249 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.51 
 
 
252 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  26.36 
 
 
241 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  28.02 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.96 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  28.9 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  27.96 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.07 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  30.46 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  30.32 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  27.86 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  26.22 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>