More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1275 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  79.83 
 
 
238 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  61.43 
 
 
215 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  60 
 
 
218 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  58.1 
 
 
218 aa  250  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  58.1 
 
 
218 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 
218 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 
218 aa  248  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 
218 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  58.1 
 
 
218 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  57.62 
 
 
218 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  57.62 
 
 
218 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  57.62 
 
 
218 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  45.99 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  44.02 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  44.49 
 
 
233 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  45.02 
 
 
239 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  39.15 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  39.47 
 
 
245 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  37.39 
 
 
241 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
232 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  35.12 
 
 
239 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.51 
 
 
258 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.87 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  33.63 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  33.63 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.45 
 
 
240 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  33.33 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 
253 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 
253 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 
249 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.5 
 
 
249 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.33 
 
 
238 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 
239 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
270 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
268 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.06 
 
 
268 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  32.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  32.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  35.04 
 
 
243 aa  121  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.47 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.46 
 
 
255 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
251 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 
235 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.33 
 
 
273 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.61 
 
 
243 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  32.33 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.48 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  34.84 
 
 
229 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
254 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.33 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  34.2 
 
 
258 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.62 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  33.48 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.58 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.05 
 
 
237 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
272 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
247 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
255 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 
245 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  34.4 
 
 
246 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 
273 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  33.33 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  31.33 
 
 
254 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.04 
 
 
231 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.57 
 
 
226 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
239 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
248 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.47 
 
 
251 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
249 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  34.4 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.86 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>