More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5664 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  91.02 
 
 
246 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
248 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  39.38 
 
 
249 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 
249 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
274 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  38.89 
 
 
273 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
268 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  38.2 
 
 
253 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  37.99 
 
 
249 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
251 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  42.36 
 
 
238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  37.45 
 
 
249 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  37.45 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 
249 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  38.75 
 
 
252 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
249 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
253 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.61 
 
 
249 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
249 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.21 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  37.39 
 
 
251 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  39.46 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  38.75 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 
244 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 
262 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  36.17 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  41.78 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
245 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
247 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  37.13 
 
 
247 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 
264 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  37.13 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  38.25 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  35.71 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  35.71 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  36.68 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
247 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  37.89 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  35.62 
 
 
272 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  37.5 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  34.5 
 
 
237 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.48 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  38.33 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 
237 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  36.73 
 
 
242 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  34.78 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 
240 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  36.28 
 
 
242 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  36.68 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  34.88 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  36.68 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  30.51 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  33.18 
 
 
236 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  32.94 
 
 
250 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.4 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  37.92 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  37.79 
 
 
233 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 
234 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 
233 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  40.54 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
259 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.89 
 
 
229 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  35.86 
 
 
275 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 
242 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  30.68 
 
 
254 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
249 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.42 
 
 
254 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  36.17 
 
 
243 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 
236 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.51 
 
 
243 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  31.78 
 
 
230 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  37.79 
 
 
260 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
233 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  36.05 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>