More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5742 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  66.95 
 
 		 236 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  61.21 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  48.09 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  34.78 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  39.27 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.32 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  32.17 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  37.44 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  33.03 
 
 		 249 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  36.4 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 274 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.39 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.62 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.98 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.83 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  32.89 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.89 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  35 
 
 		 252 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.42 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  35.64 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.12 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.36 
 
 		 272 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 299 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.5 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  33.63 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.36 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  34.93 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  32.69 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  31.11 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.7 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  30.84 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  31.3 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  34.04 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  34.04 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  30.04 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  33.81 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  30.59 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.46 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  33.95 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  35.83 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  32.91 
 
 		 284 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.2 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  35.11 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>