More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1707 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  49.34 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  41.94 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  43.89 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  42.79 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  42.92 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  42.61 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  43.56 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  41.1 
 
 		 225 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  45.74 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  42.92 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  36.24 
 
 		 230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  47.7 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  41.12 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  40.18 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  43.94 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  39.37 
 
 		 225 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  38.53 
 
 		 225 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.1 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  37.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  41.99 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  38.57 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  42.86 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  44.91 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  38.86 
 
 		 226 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  41.78 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  43.19 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.39 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  36.79 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  40.47 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  34.98 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  38.91 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  31.34 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  36.87 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  38.64 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  36.53 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  42.29 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  35.87 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.39 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  36.57 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.25 
 
 		 242 aa  95.5  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.28 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.63 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  33.49 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  38.6 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  32.69 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.35 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  36.68 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  33.94 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.49 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.91 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  25.4 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.91 
 
 		 228 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  33.49 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.73 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  34.15 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.21 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.74 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.5 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  38.46 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  38.46 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  38.46 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 232 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  38.46 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32.37 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.5 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  38.31 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>