More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0971 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  76.95 
 
 		 244 aa  325  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  58.2 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  59.58 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  57.81 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  56.85 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  57.81 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  57.38 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 254 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  57.38 
 
 		 249 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  55.6 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  55.19 
 
 		 253 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  55.19 
 
 		 253 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  55.98 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  55.98 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  55.98 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  58.16 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  57.45 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  52.87 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  54.87 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  48.75 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  51.74 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  48.31 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  50.87 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  45.8 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  50 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  47.7 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  46.34 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  48.05 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  45.26 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  44.4 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  48.28 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  43.42 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  48.28 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  43.64 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  42.24 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  44.4 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  41.33 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  45.02 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  39.5 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  42.22 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  40.09 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.64 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  43.61 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  39.64 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  39.01 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  38.79 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  39.71 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  38.22 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  38.91 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  36.12 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  45.26 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  38.33 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  37.1 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  37.1 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  40.09 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  37.26 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.87 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  37.44 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32950  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 		 143 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982848  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  31.3 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  35.27 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  35.74 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  37.98 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>