More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_32950  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  74.83 
 
 		 237 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  74.83 
 
 		 237 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  68.79 
 
 		 232 aa  189  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  68.09 
 
 		 233 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 259 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  67.86 
 
 		 233 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  68.61 
 
 		 237 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  55.15 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 270 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  48.87 
 
 		 253 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 274 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 253 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  45.77 
 
 		 249 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  45.77 
 
 		 249 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  45.77 
 
 		 249 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  52.59 
 
 		 249 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  49.63 
 
 		 272 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  52.59 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  48.12 
 
 		 253 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  48.12 
 
 		 253 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 268 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  50.74 
 
 		 262 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  48.15 
 
 		 249 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  47.41 
 
 		 249 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 247 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  45.32 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  48.87 
 
 		 247 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 254 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  47.41 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 248 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 268 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  45.19 
 
 		 273 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 247 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 272 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  54.35 
 
 		 252 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.86 
 
 		 255 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  42.96 
 
 		 244 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  45.59 
 
 		 248 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  39.46 
 
 		 251 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  40.27 
 
 		 251 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  44.14 
 
 		 236 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  48.48 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  39.85 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  38.85 
 
 		 299 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  40.88 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  39.85 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  36.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  38.52 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  38.35 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  37.86 
 
 		 266 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  38.81 
 
 		 242 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 247 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  40 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  45.39 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  37.86 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  39.53 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  41.91 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  38.52 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  36.69 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  37.31 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  35.42 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.26 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  35.25 
 
 		 250 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  40.3 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.84 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  33.57 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  35.42 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 264 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 218 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  34.59 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  35.04 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  34.65 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  34.53 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.33 
 
 		 257 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.33 
 
 		 257 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.33 
 
 		 257 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.33 
 
 		 257 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.33 
 
 		 257 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  33.33 
 
 		 233 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>