More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1217 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  95.87 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  95.87 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  95.87 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  95.87 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  94.95 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  95.41 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  95.41 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  94.95 
 
 		 218 aa  423  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  94.95 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  90.61 
 
 		 215 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  60 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  60 
 
 		 238 aa  256  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  40.58 
 
 		 240 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  40.95 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  42.03 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  40.48 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  39.42 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  37.02 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 249 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  36.1 
 
 		 249 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.57 
 
 		 272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.47 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.47 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.47 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 268 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.47 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.98 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  35.44 
 
 		 273 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 248 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.98 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.98 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.98 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.24 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 		 258 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  30.14 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  31.46 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.54 
 
 		 250 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  35.41 
 
 		 273 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  31.13 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  37.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  30.52 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  32.7 
 
 		 250 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  32.02 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 255 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  33.66 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  32.51 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  32.27 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.49 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  32.08 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 261 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.81 
 
 		 259 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  32.23 
 
 		 250 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.81 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  31.13 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  31.15 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  35.12 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  32.35 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 		 244 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.86 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 235 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 251 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  34.15 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  31.48 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.48 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  31.48 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>