More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5903 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  46.53 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  49.77 
 
 		 234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  39.42 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  49.14 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  48.67 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  44.63 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  46.12 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  47.03 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  40.91 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  41.92 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  45.21 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  49.34 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  40.09 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  45.21 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  45.21 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  45.21 
 
 		 234 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  39.19 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  44.75 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  39.75 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  40.87 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  40 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  40.43 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  37.05 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  42.36 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.94 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  40.44 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  39.91 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  36.77 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.39 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  41.2 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  37.05 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  36.96 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 237 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  36.59 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  36.96 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  37.12 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  35.43 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  39.39 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.07 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  37.44 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 244 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  36.32 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  38.53 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  38.29 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  35.56 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.83 
 
 		 226 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  38.07 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  35.53 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  34.4 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.44 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  36.52 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.6 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  39.24 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>