More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1084 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  42.44 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  50.29 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  46.63 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  42.92 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  42.53 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  43.78 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  40.85 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  47.4 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  39.71 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  41.12 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  44.34 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  43.89 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 337 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  39.25 
 
 		 216 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  38.32 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  41.51 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  48.45 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  43.28 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  35.55 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  38.86 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  40.2 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  39.7 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  45.23 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  39.15 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  37.2 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  35.55 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.45 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  35.29 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  43.78 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  35.21 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  44.51 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  33.18 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  41.36 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.18 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.57 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  38.55 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  37.5 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.27 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  36.84 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.98 
 
 		 250 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  36.36 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  35.29 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.61 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  40 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 288 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  34.59 
 
 		 244 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  37.67 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  40 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.45 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  32.63 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  34.09 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  37.33 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.6 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.85 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.25 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>