More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1205 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  71.49 
 
 		 258 aa  337  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  47.35 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  43.86 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  40.37 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  37.93 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  34.5 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.48 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  34.8 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.65 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.32 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  35.05 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  34.07 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  34.07 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  35.54 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  35.56 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  38.32 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  34.87 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  34.87 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.87 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  32.91 
 
 		 250 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  31.33 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  31.33 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  34.87 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.87 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.9 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  33.91 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.02 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  32.16 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.87 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.87 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.87 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.87 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.62 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  34.06 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.2 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  35.71 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  36.29 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.6 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.51 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.6 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.6 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.6 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  36.29 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.6 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  36.29 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  31.47 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.63 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  34.18 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.86 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  35.91 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  33.03 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.03 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.49 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.76 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  35.86 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  35.86 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.05 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.87 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>