More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0301 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  98.68 
 
 
228 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  38.43 
 
 
232 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.58 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.04 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.7 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  35.43 
 
 
238 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.63 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
241 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.3 
 
 
239 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.77 
 
 
240 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 
240 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
232 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.32 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.09 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
248 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 
243 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 
250 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.31 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.93 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  28.19 
 
 
285 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
230 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  32.51 
 
 
215 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  32.62 
 
 
254 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
258 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.84 
 
 
233 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
257 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 
257 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
261 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.12 
 
 
257 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.51 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  26.96 
 
 
258 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  26.2 
 
 
249 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 
235 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
249 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
255 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.17 
 
 
252 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  26.96 
 
 
255 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  31.22 
 
 
231 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
255 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
255 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  28.17 
 
 
254 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  26.09 
 
 
255 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
232 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  26.98 
 
 
239 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
243 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 
269 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  34.08 
 
 
240 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
255 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  29.03 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  26.98 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  25.65 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  26.78 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.65 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  26.89 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  30.59 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  25.23 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  30.58 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.6 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
318 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
366 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  24.78 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  27.19 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  24.67 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.44 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.92 
 
 
268 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>