More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2592 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  100 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  44.35 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  44.54 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  43.83 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  44 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  42.67 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  38.94 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  41.94 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  38.39 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  35.43 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.04 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  37.34 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  36.09 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  36.09 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.8 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.6 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.62 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  37.99 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.78 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.93 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  38.91 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.93 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.93 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.11 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.98 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.87 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  35.84 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.96 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  36.11 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  37 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  35.25 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  36.15 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.91 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.03 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.33 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.61 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  37.05 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.26 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  36.49 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.91 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  35.78 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.1 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.62 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  36.61 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.59 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  32.67 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.45 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  34.08 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.19 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  38.12 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.19 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  38.12 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  32.78 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>