More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4920 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  100 
 
 
231 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  50.9 
 
 
226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  50.67 
 
 
231 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  46.67 
 
 
239 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 
224 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  48.42 
 
 
224 aa  184  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  45.25 
 
 
230 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
230 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  43.38 
 
 
230 aa  175  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  38.94 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
241 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  41.52 
 
 
243 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  38.57 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.62 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  33.63 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  35.34 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 
252 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
243 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
245 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  36.19 
 
 
233 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.38 
 
 
245 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 
215 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.96 
 
 
241 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
255 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.96 
 
 
238 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  29.72 
 
 
224 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.88 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.26 
 
 
235 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.73 
 
 
228 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 
258 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.48 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.26 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.41 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  32.52 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  39.25 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
218 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
218 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
218 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
218 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
218 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  36.41 
 
 
223 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.03 
 
 
258 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.04 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  34.85 
 
 
254 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  35 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
218 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  40.37 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  28.57 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.11 
 
 
258 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.11 
 
 
258 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.11 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  36.27 
 
 
226 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.48 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.18 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.74 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  35.15 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.43 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  30.8 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.65 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  33.81 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  37.25 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.65 
 
 
258 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.5 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
249 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.73 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.19 
 
 
258 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  31.19 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  27.8 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.19 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.44 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>