More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4413 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  61.5 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  36.75 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  36.09 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.8 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.48 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  35.1 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.43 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.27 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.93 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.48 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.6 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  31.93 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.66 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.71 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  31.65 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  31.16 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  33.03 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.6 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.88 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  29.96 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.33 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.88 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.92 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.75 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  32.74 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.3 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.8 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  31.03 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.74 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  33.82 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 227 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  31.58 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  30.67 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>