More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4787 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  53.04 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  43.11 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  40.85 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.16 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.33 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.3 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.49 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.59 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.14 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  33.79 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.09 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.32 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  31.84 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  36.92 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.2 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.22 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  29.82 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  32.11 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.88 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.28 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.03 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.28 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  28.39 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.95 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.97 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  32.69 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  26.81 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  31.84 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  30.28 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  27.03 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  34.42 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  26.7 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  30.9 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  32.03 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.03 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  30.87 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  28.91 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  32.03 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.33 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  32.03 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.03 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.18 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  29.17 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  28.82 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  30.57 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  27.48 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  29.13 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  28.15 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  29.82 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  28.15 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  30.13 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.9 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  29.69 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  28.15 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>