More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2500 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  53.04 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  41.59 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  40 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  38.16 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.62 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.57 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.94 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.4 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.34 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.4 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  31.51 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.23 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.41 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.18 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.45 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.09 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.49 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  29.09 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.52 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  29.95 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.3 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  29.78 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  31.84 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.3 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.25 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.86 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.86 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.86 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  29.19 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.46 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.38 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  29.02 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.38 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.73 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.29 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.68 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.45 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  27.14 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  29.2 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  31.08 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  28.69 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  25.55 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  26.64 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  30.41 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.44 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  26.32 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  32.66 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  32.12 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  31.73 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  30.9 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2628  regulatory protein GntR HTH  27.23 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404376  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  30.94 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.16 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  33.5 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.31 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  29.36 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.73 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  31.12 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>