More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2705 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  49.33 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  40 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  40.85 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  32.43 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.44 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.4 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.73 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.67 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.33 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  31.8 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  30.6 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.44 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.56 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.94 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.94 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.2 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.54 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  36.65 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  34.4 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.47 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.75 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  29.15 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  28.33 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  31.51 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.75 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.75 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  28.7 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  32.68 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  33.79 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.6 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.23 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.7 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.51 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.18 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  32.44 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.35 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  31.09 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.35 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  25.33 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.57 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  31.17 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  27.31 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  27.83 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.26 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  26.7 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  27.06 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  33.64 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  33.64 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.87 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.64 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  29.55 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  29.22 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  35.09 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>