More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1298 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  54.31 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  51.3 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  48.87 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  47.35 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4243  GntR domain-containing protein  45.66 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  38.53 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  36.12 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  38.16 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  38.89 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  40.58 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.55 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.91 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  38.39 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  37.05 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  36.32 
 
 		 249 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  39.05 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  36.07 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  37.68 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  38.6 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  34.76 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  35.68 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  34.84 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  35.02 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.1 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 337 aa  98.2  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.41 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.05 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  35.45 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  37.56 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  37.73 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.8 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.97 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  36.45 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  26.22 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.98 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.78 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  34.52 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.57 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.19 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.48 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.49 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.86 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  27.75 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  37.5 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  33.94 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  37.14 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.12 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.85 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  35.37 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  33.78 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>