More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3725 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  73.57 
 
 		 234 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  72.05 
 
 		 235 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  69.57 
 
 		 235 aa  331  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  49.13 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  45.89 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  42.11 
 
 		 258 aa  168  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  39.29 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  38.5 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  38.5 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  43.35 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  37.72 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  37.72 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  37.72 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  37.72 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  37.28 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  33.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  38.6 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.63 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.65 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.05 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.48 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.96 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  32 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 379 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.56 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.49 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.48 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.84 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  31.72 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.95 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.39 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  30.45 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  32.43 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  26.94 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.82 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  31.82 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.46 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.46 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.27 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.39 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  29.91 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  27.6 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  35.43 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.94 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.62 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  30.93 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.39 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>