More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0915 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  95.58 
 
 
226 aa  441  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  43.27 
 
 
222 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  42.44 
 
 
226 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
222 aa  159  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  38.28 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  41.79 
 
 
218 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  42.2 
 
 
235 aa  148  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  37.27 
 
 
222 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  41.62 
 
 
229 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  38.61 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  37.62 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  38.07 
 
 
224 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  37.62 
 
 
230 aa  138  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  37.32 
 
 
223 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
215 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  32.54 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  40.12 
 
 
226 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 
215 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
221 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  38.35 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  36.78 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
226 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 
225 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  35.07 
 
 
231 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 
216 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 
216 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
216 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  33.33 
 
 
231 aa  122  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  38.35 
 
 
227 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
226 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  40.24 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  36.11 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  35.4 
 
 
234 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  34.65 
 
 
241 aa  114  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  32.68 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  34.48 
 
 
217 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 
224 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  35.98 
 
 
226 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
225 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
337 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
243 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.33 
 
 
241 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  31.86 
 
 
225 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 
249 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
236 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  29.86 
 
 
237 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 
249 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 
249 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  27.75 
 
 
234 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.63 
 
 
249 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  31.37 
 
 
225 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.78 
 
 
239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
254 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  26.43 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.46 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.78 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  32.67 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  27.31 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
255 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.29 
 
 
249 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.19 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 
252 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.78 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  29.33 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  31.11 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  32.93 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  30.37 
 
 
237 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  35.05 
 
 
240 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  30 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.48 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.46 
 
 
239 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
226 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.86 
 
 
259 aa  92  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
255 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>