More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1517 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  59.39 
 
 		 263 aa  278  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 260 aa  278  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 260 aa  278  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 263 aa  278  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 260 aa  278  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 260 aa  277  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  58.7 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  58.7 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  58.7 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  58.7 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  59.39 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  58.7 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  56.52 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  45.5 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  38.22 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  36.24 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  34.98 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  35.81 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  33.18 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  33.18 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  41.24 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.8 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  32.17 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.88 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.96 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29.6 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.92 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.02 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.2 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  29.2 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.89 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  29.15 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  25.11 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.59 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  28.26 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.55 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.31 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.2 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.39 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  29.19 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.71 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  25.99 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  28.28 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  25.99 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  30.81 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  25.78 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  27.32 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  28.28 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  26.92 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  27.48 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  24.77 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  28.5 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.12 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  30.32 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  30.81 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  32.4 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  26.58 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.6 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  24.67 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  27.43 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  29.84 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  27.23 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  27.49 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  25.9 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  29.79 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>