More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1464 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  100 
 
 
249 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  42.08 
 
 
254 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
252 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.38 
 
 
250 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  35.62 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  36.82 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.53 
 
 
238 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  38.42 
 
 
226 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  38.83 
 
 
227 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  31.78 
 
 
235 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  37.17 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.67 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.82 
 
 
241 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.9 
 
 
215 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.92 
 
 
245 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
231 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  35.05 
 
 
237 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.59 
 
 
241 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  37.26 
 
 
234 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  38.78 
 
 
234 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 
240 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
218 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
218 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  35.81 
 
 
258 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
226 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
218 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
218 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  32.38 
 
 
237 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.57 
 
 
239 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  32.24 
 
 
234 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.36 
 
 
240 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  36.54 
 
 
226 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
215 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 
215 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
274 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  32.87 
 
 
229 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  35.75 
 
 
233 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 
248 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  31.73 
 
 
233 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
253 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
232 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
268 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
224 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.54 
 
 
253 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  35.41 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  31.31 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  35.41 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  35.41 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.92 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.96 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.43 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  35.07 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
255 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  34.23 
 
 
239 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
248 aa  99  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.14 
 
 
249 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  34.5 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  36.53 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  36.59 
 
 
224 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  34.14 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.26 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  36.92 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  35.35 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  36.92 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.94 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  30.28 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  37.31 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  32.54 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.85 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  30.05 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.69 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  36.59 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  34.26 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.98 
 
 
238 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.79 
 
 
240 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
247 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
230 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  35.53 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>