More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3646 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  95.81 
 
 		 215 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  53.59 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  53.59 
 
 		 216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  52.15 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  50.23 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 235 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  45.19 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  43.2 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  42.11 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 337 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  42.59 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  42.18 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  43.87 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  42.18 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  47.02 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  39.71 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  41.09 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  39.23 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.39 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  40.4 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  43.48 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  40.19 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  46.75 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 226 aa  131  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  38.97 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  37.8 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  37.44 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  39.51 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  43.02 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  38.71 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  35.19 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.66 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  41.43 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  39.05 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.35 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  38.64 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  32.2 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.02 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  40.38 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  35.41 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  38.57 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.56 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  36.63 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  38.27 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  38.33 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.81 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.31 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  35.21 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  37.44 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  35.71 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  35.58 
 
 		 268 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 257 aa  98.2  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.63 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  34.67 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  34.67 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 258 aa  95.1  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  40.78 
 
 		 246 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  34.67 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  34.93 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 258 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.01 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 258 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.67 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  31.34 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  42.77 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.22 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.37 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.01 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 261 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  30.73 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>