More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3974 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  80.77 
 
 		 234 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 242 aa  281  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  53.04 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  48.91 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  49.54 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  51.15 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4243  GntR domain-containing protein  47.65 
 
 		 175 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  38.68 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  35.68 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  40.24 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.99 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.31 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 274 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  31.25 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.62 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.48 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.96 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  35.94 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  35.48 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.87 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  35.09 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.64 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 337 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.95 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.17 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  31.11 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  35.35 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.02 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.85 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  36.14 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  34.39 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  35.78 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.86 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  34.45 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  25.23 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.51 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.3 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  34.42 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  31.11 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.51 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.44 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  25.23 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.91 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  33.83 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.93 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  32.61 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.68 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  31.71 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  33.66 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.82 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  28.51 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.38 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  33.94 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  31.94 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.38 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>