More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0637 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  100 
 
 
252 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  58.17 
 
 
253 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  58.57 
 
 
253 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  58.96 
 
 
251 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  57.77 
 
 
253 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  56.92 
 
 
255 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  56.92 
 
 
255 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  56.92 
 
 
255 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  57.31 
 
 
251 aa  268  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0881  GntR domain protein  55.1 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
255 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  32.93 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  34.17 
 
 
255 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  35.8 
 
 
240 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  37.55 
 
 
253 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 
239 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  38.78 
 
 
244 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  36.07 
 
 
231 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
245 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  34.6 
 
 
247 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 
247 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  34.6 
 
 
247 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.48 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  35.29 
 
 
244 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  35.59 
 
 
244 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.5 
 
 
239 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
250 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  37.72 
 
 
237 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  32.63 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  34.43 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  33.61 
 
 
268 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  42.02 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  36.82 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 
233 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
256 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  35.62 
 
 
252 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.2 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.95 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  35.39 
 
 
240 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.54 
 
 
239 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
257 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  35.39 
 
 
240 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.1 
 
 
250 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.3 
 
 
259 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  32.23 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  32.23 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  32.23 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.23 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  32.08 
 
 
255 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  31.67 
 
 
255 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.92 
 
 
245 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.23 
 
 
257 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.23 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.23 
 
 
257 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.23 
 
 
257 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.23 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.77 
 
 
258 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.8 
 
 
264 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
233 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 
234 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.8 
 
 
264 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 
249 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.8 
 
 
264 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
230 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
235 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  33.61 
 
 
247 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  31.85 
 
 
246 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  30.86 
 
 
255 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01468  putative regulatory protein, GntR family  33.87 
 
 
243 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.1 
 
 
258 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.08 
 
 
258 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.67 
 
 
257 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.67 
 
 
257 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.67 
 
 
257 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.08 
 
 
258 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.67 
 
 
257 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.67 
 
 
257 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  31.58 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  34.33 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.25 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  30.93 
 
 
233 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.02 
 
 
233 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.74 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  32.81 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  32.81 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.81 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  32.81 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.81 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.8 
 
 
240 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>