More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2815 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  60.85 
 
 		 264 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  60 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  53.1 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  42.46 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  51.12 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  52.65 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  49.12 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  49.12 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  49.78 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  49.78 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  49.78 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  49.78 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  49.33 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  43.3 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  40.08 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  39.11 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  35.32 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  35.32 
 
 		 248 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  35.74 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.21 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  38.63 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  38.63 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  38.63 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  39.19 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  36.44 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  38.36 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  36.52 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.27 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  40.83 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  34.69 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  36.12 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  35.34 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  37.28 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 240 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  36.41 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  33.03 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.86 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.65 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  37.18 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  38.46 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.03 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  37.93 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  32.26 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  34.65 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  42.44 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.27 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  41.98 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  45.29 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.6 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  36.12 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  38.57 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.47 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>