More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1163 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  100 
 
 
230 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  49.77 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  55.93 
 
 
235 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  54.75 
 
 
229 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  46.82 
 
 
224 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  50 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  52.17 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  49.3 
 
 
226 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  49.76 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  49.77 
 
 
217 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  47.95 
 
 
233 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  50.45 
 
 
221 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  47.49 
 
 
225 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  41.79 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  45.97 
 
 
222 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  53.49 
 
 
233 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  43.72 
 
 
225 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  43.26 
 
 
225 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
221 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
221 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  45.74 
 
 
252 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  46.63 
 
 
226 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  46.76 
 
 
231 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  41.51 
 
 
226 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  48.26 
 
 
227 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
215 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  41.38 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  41.26 
 
 
229 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
337 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  46.6 
 
 
224 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  43.86 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  43.06 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
219 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
226 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  37.33 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  41.87 
 
 
216 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  40.55 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  39.52 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  41.38 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  36.41 
 
 
218 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  42.36 
 
 
224 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.48 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  39.71 
 
 
231 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
222 aa  111  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  34.31 
 
 
222 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  41.98 
 
 
264 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  45.11 
 
 
226 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  43.56 
 
 
264 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.33 
 
 
240 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  43.83 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  36.49 
 
 
284 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.51 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.59 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.17 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1150  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  38.91 
 
 
238 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
255 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  38.91 
 
 
253 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.85 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.27 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.5 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.28 
 
 
250 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
233 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.87 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  37.14 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
288 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.58 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  34.7 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  37.87 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.68 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  31.16 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  33.49 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.95 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>