More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1365 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  50.23 
 
 
215 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
337 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
225 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
235 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  44.14 
 
 
225 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  41.7 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  43.56 
 
 
252 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  43.78 
 
 
231 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  43.78 
 
 
225 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  43.46 
 
 
216 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  42.86 
 
 
225 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  46.15 
 
 
223 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  46.6 
 
 
230 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  43.46 
 
 
216 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  42.47 
 
 
231 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 
219 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
221 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
231 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  42.06 
 
 
216 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  44.81 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
221 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
221 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  42.41 
 
 
233 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  41.55 
 
 
231 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  38.07 
 
 
230 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  46.2 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  46.51 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  37.62 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  39.61 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  41.63 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  41.26 
 
 
225 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  42.25 
 
 
224 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  47.19 
 
 
233 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  39.29 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  42.45 
 
 
217 aa  121  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  38.57 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  35.29 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  37.13 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  41.67 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.49 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  42.59 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
222 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  35.29 
 
 
222 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.85 
 
 
238 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  43.35 
 
 
224 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.56 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
231 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  34.1 
 
 
264 aa  94.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.87 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 
240 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.42 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.07 
 
 
273 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.52 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  32.55 
 
 
222 aa  92  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  37.57 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  35.83 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.51 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.52 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.18 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
270 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.18 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  33.65 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  33.33 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  33.52 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.72 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  39.2 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  45 
 
 
284 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
253 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.52 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.97 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  33.33 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>