More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6865 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  51.33 
 
 		 231 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  51.35 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  47.64 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  42.29 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  42.08 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  41.63 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 337 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  40.72 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  44.66 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  42.11 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  42.59 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  48.68 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  42.11 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  38.57 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  44.6 
 
 		 226 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  46.35 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  41.23 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  43.84 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  41.23 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  40.85 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  41.71 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  40.38 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  46.63 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  37.28 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  44.57 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 241 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  35.56 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  37.14 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  35 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  39.29 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  41.32 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.63 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  35.04 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  39.11 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  38.5 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  38.05 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  38.04 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  43.67 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  42.44 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  38.94 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.56 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  36.89 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  40.13 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  40.88 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  41.33 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  35.74 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.78 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  32.77 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.95 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.95 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.95 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.46 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.61 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.42 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.7 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.74 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.73 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  33.78 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  33.33 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.88 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.96 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  37.74 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.95 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.66 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.66 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.66 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.71 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>