More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4529 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  84.16 
 
 		 227 aa  325  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  51.05 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  51.94 
 
 		 241 aa  177  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  49.76 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  46.01 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  49.03 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  48.54 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  48.34 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  47.09 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  48.97 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  41.78 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  37.68 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  43.28 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  38.35 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  35.78 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  41.78 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  44.39 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  48.44 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  40.4 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  42.33 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  42.92 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  36.84 
 
 		 231 aa  127  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  38.46 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 337 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.98 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  42.16 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  41.62 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  39.13 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  39.8 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  40.1 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  36.89 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33.16 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  47.53 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.96 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  37.12 
 
 		 299 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.18 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.84 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  35.5 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.41 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  39.63 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.86 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  35.92 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  38.19 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  36.07 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  36.53 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.68 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.01 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  30.8 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  38.31 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.79 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.68 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.49 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  38.6 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  38.73 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0632  regulatory protein GntR HTH  33.16 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.16 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  37.09 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>